La chiesa di San Francesco, edificata nel XIV secolo, divenne poi luogo di culto della potente famiglia Fortebracci. Tipica degli ordini mendicanti, presenta una navata unica con capriate, ampie finestre e luce che entra dalle monofore e dalla bifora sull’abside poligonale.

L’abside ospita affreschi di Antonio Alberti (1422-1424) raffiguranti episodi della vita di San Francesco e il Giudizio Universale, mentre lungo le pareti restano lacerti di affreschi XIV-XV secolo, tra cui San Giovanni Battista, San Sebastiano e la Cena a casa del Fariseo. Di pregio sono il coro ligneo del XV secolo, il bancone dei Magistrati in legno intagliato e intarsiato e il portale ligneo cinquecentesco di Antonio Bencivenni.

La chiesa conserva anche altari e affreschi votivi realizzati dai Fortebracci e dai loro committenti, tra cui opere di Bartolomeo Caporali. Oggi San Francesco ospita regolarmente esposizioni di arte contemporanea e fotografia, che dialogano con l’eleganza medievale dell’edificio.